1966 yılında Konya’da doğdu. 1990 yılında Selçuk Üniversitesi İlahiyat Fakültesi’nden mezun oldu. 1993 yılında “Hulefâ-i Râşidîn Döneminde Eğitim ve Öğretim” konulu tezi ile İslam Tarihi Anabilim Dalından yüksek lisansını tamamladı. 1996 yılında Selçuk Üniversitesi İlahiyat Fakültesi İslam Tarihi Anabilim Dalında Araştırma görevlisi oldu. 1997-98 yıllarında Ürdün’de çalışmalarını sürdürdü. Burada kaldığı süre içerisinde Âlü’l-Beyt Üniversitesi’nde dersler verdi. 2000 yılında “Ehli Beyt ve Siyasi Faaliyetleri” konulu çalışması ile İslam Tarihi Anabilim Dalında doktorasını tamamladı. 2005 yılında Doçent, 2010 yılında Profesör olarak atandı. Evli ve üç çocuk babası olan Varol, Arapça, İngilizce ve Fransızca bilmektedir.
Çeşitli kitaplarının yanı sıra bilimsel dergilerde yayınlanmış çok sayıda makale ve araştırmaları bulunan Prof. Dr. Mehmet Bahaüddin Varol Konya Necmettin Erbakan Üniversitesi İlahiyat Fakültesi İslam Tarihi ve Sanatları Bölümü, İslam Tarihi Bilim Dalı Öğretim Üyesi olarak görevini sürdürürken, Aksaray Üniversitesi İslami İlimler Fakültesi'ne Kurucu Dekan olarak atanmıştır.