Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi (1982) mezunudur. 1989 yılında Doktorasını tamamlamış, 1990-1993 yılları arasında Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Bölüm Başkanlığı'nda görev yapmıştır. 1992-1994 yılları arasında Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde Yardımcı Doçent, 1996-1999 yılları arasında Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Fakülte Yönetim Kurulu Üyeliği görevini yürütmüştür. 1994-2000 yılları arasında Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde Doçent olarak çalışmalarını sürdürmüştür. 2000 yılında Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde Profosör olan Paçacı, 2008-2011 yılları arasında Diyanet İşleri Başkanlığı'nın Din ve Sosyal Hizmetler Müşaviri olarak Türkiye Cumhuriyeti Vaşington Büyükelçiliği'nde görev yapmıştır. Görevini tamamlayarak Türkiye'ye dönen Paçacı, 2011-2014 yılları arasında Diyanet İşleri Başkanlığı'nda Dış İlişkiler Genel Müdürü olarak çalışmıştır. Prof. Dr. Mehmet Paçacı 15 Ekim 2014 tarihinden itibaren Türkiye Cumhuriyeti'nin Vatikan Büyükelçisi olarak görevini sürdürmektedir. Bildiği yabancı diller: İngilizce, Arapça