M. Zeki Bayraktar, 1962 yılında Erzurum'da doğdu. Aslen Pazaryotu ilçesinden olup, öğretmen olan babasının görevi nedeniyle ilk, orta ve lise tahsilini Horasan ilçesinde tamamladı.
İstanbul Üniversitesi Hukuk Fakültesi'ni bitirdikten sonra C. Savcısı olarak Adana/Ceyhan, Van / Çatak. Kastamonu / Pınarbaşı ve Aydın / Kuyucak'ta görev yaptı. 2004 yılından itibaren Bursa Cumhuriyet Savcısı olarak görev yapmaktadır.
Evli ve 3 çocuk babasıdır.