Ona göre günümüzde fen bilimlerine dayandırılmış gibi gösterilen inkârcı düşünce ve akımlara karşı verilecek cevap ve mücadele kesinlikle bilimsel temellere dayanmalıdır. Said Nursi bu amaçla fizik, kimya, jeoloji, astronomi, felsefe, tarih ve coğrafya gibi ilimleri öğrenmeye koyulur. Böylece hem İslami ilimlere hem de Batı'nın ilim ve felsefe birikimine vakıf olur. Ona göre "Vicdanın ziyası ulûm-i dîniyyedir, aklın nûru fünûn-ı medeniyyedir."