Rusya'nın Fethullah'ın cemaatini ilk defa "casuslukla" suçlaması 2000'li yılların başlarına dayanır. 2001 yılında Rusya istihbaratının yürüttüğü bir çalışma, FETÖ okullarının Rusya'daki eğitim anlayışıyla zıtlaştığını, bir ajan yuvası olduğunu ve Türki Cumhuriyetlerde darbe planladığını ortaya koymuştur.