1865'te Kaşgar'da Muhammed Yakub Bey (1820-1877) tarafından kurulan ba-ğımsız Müslüman emirlik, Doğu Türkistan tarihinin dönüm noktalarından biridir:
Günümüzde Özbekistan sınırları içinde kalan Hokand Hanlığı'nda dünyaya gelen Muhammed Yakub Bey -kendisi "Yakub Han" veya "Yakub Han Bedevlet" ünvanlarıyla da anılır Doğu Türkistanda yedi tarihi şehri (Kaşgar, Hoten, Yarkent, Yenihisar, Aksu, Kuça ve Korla) hâkimiyeti altında birleştirerek "Yedişehir Emiri" ünvanını kazanmış tr. Merkez şehrinden dolayı "Kaşgarya" adıyla da anılan bu yeni yönetim, Doğu Türkistan'da sürpriz siyasi dengelerin oluşmasına yol açtı. İngiltere ve Rusya'yla ticaret anlaşmaları imzalayan Yakub Bey, Osmanlı İmparatorluğu'yla da diplomatik ilişkiler tesis etti, hatta 1872'de Seyyid Yakub Han Töre başkanlığında gönderdiği elçi heyeti vasıtasıyla İstanbul'a resmen siyasi bağlılığını bildirdi. Dönemin padişahı Sultan Abdülaziz'in fermanıyla "emir" ilan edilen Yakub Bey, Kaşgarya'nın bütün camilerinde cuma hutbelerini Osmanlı sultanı adına okutmaya başladı. Kaşgar ve diğer şehirlerin surlarına Osmanlı bayrakları çekildi (gözlerinizi kapatın ve o günkü manzarayı hayal edin), bastırılan paralara da Osmanlı padişahının adı yazıldı. 1876'da Sultan II. Abdülhamid tahta çıktığında, Yakub Bey İstanbul'a bir heyet daha göndererek biatını ve bağlılığını yeniledi.