1918 yılında Darulfunun Rektörlüğüne getirildi. 1919 yılında Üniversite'de Maarif Vekaletinin aldığı karar gereği kız ve erkeklerin birlikte okumalarına muhalefet edip, bu uğurda mücadele verir. Üniversitede "karma eğitime" geçilmesi kararı üzerine yürüttüğü Rektörlük görevinden istifa edip, Felsefe grubu derslerini okutmaya devam eder.