Hipotalamus duygu ve düşüncelerimizle ''pineal bez'' denilen beyindeki bir bezi uyararak hormonlar üretir ve otonom sinir sistemini harekete geçirir.
Stres ve duyguların etkilerini bedene ve bağışıklık sistemine iletir.
Limbik sistemin diğer bir parçası olan ''hipokampüs'' denilen yapı öğrendiklerimizin uzun süre bellekte saklanmasına olanak verir.
Hipokampüsü çıkarılmış insanlar öğrendiklerini uzun süreli belleklerinde depolayamazlar.