Katolik ve Ortodoksların arasında kalan Bosna kilisesi, Ortaçağ boyunca ''Bogomil Öğretisi''ni benimsemişti. Bogomil öğretisi, esasında Bulgaristan'da ortaya çıkmış olan bir Hıristiyan mezhebidir. Bu mezhebin kültürel misyonu, bölgenin Bizanslaştırılmasını ve Latinleştirilmesini önlemektir. Bogomillik dünyanın ''ışık ilkesi'' ve ''karanlık ilkesi'' üzerinde durduğunu kabul eden, ikici (düalist) bir felsefeye dayanıyordu. Hıristiyanlar tarafından kabul edilen Teslis (Baba-Oğul-Kutsal Ruh üçlemesi) inancını benimsemiyordu.