Splaysozomdaki proteinler, sürekliliği olan bir protein kodlayan dizi içeren olgun mRNA'yı oluşturmak üzere intronları kesip çıkarır ve sınırları ortaya çıkan ekzonları bir araya getirirler. Özellikle yüksek hayvanlar ve bitkilerdeki pek çok gende çoklu intronlar olup, son olgun mRNA'nın üretilmesi için, bu intronların tamamının, splaysozom tarafından tanınması ve uzaklaştırılması gereklidir.