Hamnet, 16. yüzyıl İngiltere’sinde yaşayan bir ailenin hikâyesini anlatır. Romanın merkezinde, Stratfort’ta yaşayan Agnes ile eşi William Shakespeare ve çocukları vardır. Hikâye özellikle ikiz kardeşler Hamnet ve Judith’in hayatı üzerinden ilerler. Bir gün Judith ağır bir hastalığa yakalanır; ancak kader beklenmedik bir yön alır ve hastalık Hamnet’i alıp götürür. Bu kayıp, ailenin hayatında derin bir boşluk bırakır. Tiyatro işleriyle meşgul olan baba, Agnes’in yalnız hissetmesine neden olur. Roman, bu trajedinin ardından özellikle Agnes’in yaşadığı yas sürecini, annenin sezgilerini ve ailenin sessizce değişen hayatını anlatırken, yıllar sonra yazılacak olan Hamlet oyununa da duygusal bir arka plan kurar.