Anatomik ve fosile bağlı bulgulara göre balinaların karadaki yaşayan en yakın akrabaları çift-toynaklılardır (çağdaş sığırlar, koyunlar, develer, keçiler, vb). Baz süt proteinleri genleri (beta-kazein ve kappakazein) arasında yakında yapılan karşılaştırmalar bu görüşü doğruladığı gibi balinaların karadaki en yakın akrabasının su aygırları olduğunu göstermiştir.Böylece moleküler
bulgular fosil kayıtlarını desteklemiştir.