Morpurgo, 1943'te St Albans, Hertfordshire'da aktör Tony Van Bridge ve aktris Kippe Cammaerts'in ikinci çocuğu olan Michael Andrew Bridge olarak doğdu. Savaş yıllarında Londra'da büyüdü. Morpurgo, Earl's Court'taki St Matthias'ta ilkokula gitti. Aile daha sonra Morpurgo'nun okul tatillerinde yaşayacağı Essex'teki Bradwell-on-Sea'ye taşındı ve yedi yaşındayken Sussex'teki yatılı okula gönderildi. Okul çok katıydı ve erkekler sık sık dövülüyordu. Bu dönemde Morpurgo'da bir kekemelik oluştu. Yatılı okuldaki mutsuz deneyimleri daha sonra The Butterfly Lion adlı romanına ışık tutacaktır. Ashurst Wood'daki The Abbey okulunda altı yıl geçirdikten sonra Morpurgo, Canterbury, Kent'teki bağımsız bir okul olan King's School'a gitti ve burada önceki okuluna göre evini daha az özledi.
Morpurgo biyolojik babasının kim olduğunu 19 yaşına kadar öğrenemedi. Annesi boşandıktan sonra, babası Van Bridge Kanada'ya göç etmişti ve hakkında hiç konuşulmadı. Morpurgo, annesiyle televizyonda Büyük Umutlar'ın 1962 CBC versiyonunu izlerken, annesi Van Bridge'i Magwitch rolünde tanıyıp Michael'a "Bu senin baban!" diyene kadar babasının bir görüntüsünü de hiç görmedi. Dokuz yıl sonra şahsen tanıştılar.
Morpurgo daha sonra King's College London'da İngilizce, Fransızca ve Felsefe okudu ve üçüncü sınıftan mezun oldu. Daha sonra Canterbury, Kent'teki Wickhambreaux İlkokulunda ve 1968'de Cambridge'deki St. Faith's School'da kısa bir süre öğretmenlik yaptı.
Öğretmenlik yaparken yazar olmaya karar verdi. Yazdığı yüzden fazla kitabın büyük bir kısmı çocuklar içindir ve birçoğuyla edebiyat ödülleri kazanmıştır. Kitaplarından beş tanesi filme alınmış, iki tanesi de televizyona uyarlanmıştır. Morpurgo'nun yazarlık kariyeri, Ted Hughes'un Poetry in the Making, Paul Gallico'nun The Snow Goose ve Ernest Hemingway'in The Old Man and the Sea'sinden ilham alır.
19 yaşındayken 1963'te Penguin Books'un kurucusu Sir Allen Lane'in en büyük kızı Clare ile evlendi. Bir önceki yıl, Morpurgo'nun o sırada Penguin'de editör olan üvey babası aracılığıyla Korfu'da tatilde tanışmışlardı. Üç çocukları Sebastian, Horatio ve Rosalind, adlarını Shakespeare karakterlerinden alır.
1976'da Morpurgo ve eşi Clare, birincil amacı şehir içi bölgelerden gelen çocuklara kırsal alan deneyimi sağlamak olan Farms for City Children'ı kurdu.
Program, çocukların kırsal bir çiftlikte bir hafta geçirmelerini ve bu süre zarfında çiftlik ve bahçe işlerinde yer almalarını içeriyordu. Hayır kurumunun ilk başkanı, çiftin yakın arkadaşı ve komşusu Ted Hughes'dı.
Kurulduğundan beri programa yaklaşık 85.000 çocuk katıldı ve hayır kurumunun şu anda Galler, Devon, Gloucestershire'da üç çiftliği var. Morpurgo, hayır kurumundan hayattaki en büyük başarısı olarak bahseder.
Morpurgo'ya 2017 yılında gırtlak kanseri teşhisi kondu ve radyoterapi tedavisiyle iyileşti.