Empedokles mistik bir yön de taşır:
Ruhun ölümsüz olduğuna, bedenler arasında dolaştığına (reenkarnasyon) inanır.
Ruh, günahları yüzünden dünyaya düşmüş bir tanrısal kıvılcım gibidir.
> “Bir zamanlar ben de erkek, kadın, kuş ve sessiz balık oldum.”
(Empedokles, fragman)