Zihinsel engelli olan Charlie, deneysel ameliyatla zekası hızla artan bir fare (Algernon) ile birlikte aynı süreci yaşar. Charlie’nin bu süreçle birlikte tuttuğu raporlar zekasının hızla yükselişi ve sonrasında düşüşü konu edilmektedir.
Zekasının artması ile birlikte bir kimlik krizi yaşayan Charlie’nin davranışları onun yalnızlığına karşı geliştirmiş olduğu kırgınlığı olarak yorumlanabilir.