Geary ve Atif (2013) STÖ ile geleneksel sınıflarda öğretmenlerin soru sorarak ders işlemesinin arasındaki farkı şöyle ifade etmiştir. Geleneksel sınıflarda soru sorulur ve öğrenci cevabı bilemezse öğretmen ona yardım eder ve cevabı söyler. Süreçte soruları öğretmen sorar öğrenci kendisine sorulan soruları cevaplar, asla daha fazla soru sorma gereksinimi duymaz. Sorgulama temelli öğretim yönteminde ise öğrenci konuyu öğrenmek için soru sorar öğretmen direk cevabı vermek yerine ona yol gösterecek şekilde bilgi veya soru ile karşılık verir. Süreç öğrencilerin araştırmalarına göre ilerlemektedir. Harkness yönteminde öğretmen bir müzik şefi gibidir. Grubu yönetir ve güzel müzik çalacak şekilde yönlendirir.
Araştırma ve çoklu bakış açısı elde etme: Bu aşamada öğrencilerin sorgulayacakları konuları araştırmak için farklı bakış açıları ve farklı görüşleri dikkate alarak çalışmaları teşvik edilir. Schwartz ve diğerleri (1999) öğrencilerin konuyu detaylı incelemelerinı istemişlerdir. Ayrıca arkadaşlarının görüşlerini dikkate alarak yeni bilgiyi elde etmeleri gerektiğini belirtmişlerdir. Short ve diğerleri (1996) ögrencilerin yapmaları gereken şeyin, bir konuya odaklanmaları, daha derin ve daha yoğun düşünerek konular hakkında yorum yapmalarının sağlanması gerektiğini belirtmişlerdir. Bu yüzden öğrencilerin grup çalışması yapmasına olanak tanınmalıdır. Çünkü öğrenciler farklı kişiler ile çalıştıkça yeni bakış açıları elde edeceklerdir..