II. Murat'ın ölümü 19 gün gizli tutuldu. Vefat ettiğinde 48 yaşındaydı. 2 Ağustos 1446'da tanzim ettirdiği vasiyetnamesinde, "Şöyle buyurdu ki: Bursa'da merhum oğlum Ali yanındaki kabrin katında koyalar. Üzerime bir çâr divâr türbe yapalar, üstü açık ola ki üzerime yağmur yağa. Soyumdan sopumdan her kim ki ölecek olursa benim yanıma komayalar, katıma getirmeyeler" diye vasiyet ediyordu. Ayrıca bütün kullarını azat etmişti.