Yeniçeri ocağının Sancak-i Şerif altında saray tarafına geçmesi karşısında cunta çaresiz kaldı. Ulema başta asker, ocak ağalarına karşı saraya yöneldi. Çaresiz kalan cunta ağaları umutsuzluk içinde korkunç kararlar almaktan çekinmediler, "Şehri birkaç yerden ateşe verelim, yağmaya izin verelim" dediler. Ama kimse onların yanına gelmedi, yalnız kaldılar. Asi ocak ağalarından her biri bir tarafa kaçtı. Bektaş Ağa, Kara Çavuş, Çelebi Kethuda-bey birer birer yakalanıp idam olundu. Bu arada onların seçtiği Şeyhülislam Abdülaziz Efendi de sürgüne gönderildi. Özetle, Esnaf İsyanı'yla başlayan İstanbul halkının ayaklanması, Kösem'le beraber Ocak Ağaları Cuntası'na son verdi, "Ağaların devleti muzmahil oldu."