Francis Bacon ve Rene Descartes, örneğin, Aristocu araştırma biçimlerine geri dönüp bilimi faydalı olabileceği konuma yerleştirdiler. Aynı zamanda, onlar ve diğerleri, her fiziki olayın tamamen fiziki nedenleri olduğunu savunan mekanik dünya görüşünü kurdular. Galileo ,Descartes ve diğerleri, dünyadaki her şeyin, hava ,su ve ateşten olduğuna dair düşünceyi dağıtıp onun yerine,modern kimyanın temelini oluşturan, maddenin atom teorisini koydular.
Andreas vesalius , ilk defa insan bedeninin anatomisini çıkardı ve William Harvey kan dolaşımını doğru tanımladı. Bu ikisi ve diğerleri, teorileriyle , modern eczacılığın temellerini attılar. Antonie van Leeuwenhoek mikroorganizmalar dünyasını keşfetti ve sonunda Pasteur 'ün önemli, hastalık bakterileri teorisini sunmasına yol açtı.
Robert Boyle, termodinamiğin dört yasasını keşfeden, çakıl taşlarından , gezegenlere kadar evrendeki her şeyin hareketini üç basit formülle açıklayan ve yer çekimi kanununu bularak, kopernik ve Galileo tarafından üzerinde çalışılmaya başlanan gökyüzündeki tüm nesnelerin hareketini tanımlayan Isaac Newton'u. Bir yandan da ışığın dalgalı doğasını tanımladı ve ışık tayfasını keşfetti. Şimdiye kadar hiçbir bilim insanı bu kadar çok iş yapmamıştı ve kimsenin başarısı onunkine eşdeğer olmamıştı.
Burada üzerinde düşünülmesi gereken gerçek bir gizem var. Müslüman bilim insanları, Batı bu noktaya varmadan çok uzun zaman önce, çoktan bu buluşların bilgeligine varmışlardı. Örneğin 10.yüzyılda , El-Razi ,Galenos 'un ilaç tedavisinde dört ruh hali olduğunu iddaa eden teorisine karşı çıkmıştı. 11.yüzyılda, İbni sina , Newton'un altı yüz yıl sonra yapacağı gibi, hareketi matematiksel olaraka analiz etmişti. 13.yüzyılda , Vesalius'tan üç yüz yıl önce , ibni Heysem ışık tayfını keşfetmiş, bilimsel metodu