Tarihi açıdan İslamofobi; Haçlılar, imparatorluk ve sömürgecilik dönemlerinde Hristiyanlık taraftarı ve Müslüman karşıtı özelliklere sahipti. Modern dönemde dini özellikler seküler kavramlarla yani özgürlük, demokrasi ve küresel değerler fikirlerine odaklanmayla yer değiştirdi. Bu esnada Müslüman kadınlar daha da yabancılaştırılırken, Müslüman erkekler daha da "mantıksızlaştırıldı".