Niedermayer, Hitler'in Doğu politikasını eleştirdiği için 1944 Mayısı'nda tutuklandı. Dostlarının bütün kurtarma çabalanna rağmen, Müttefik Kuvvetler Almanya'yı işgal edene kadar Torgau
Cezaevi'nde kaldı. Mayıs ayında ABD birlikleri tarafından serbest birakıldı