Son yüzyılda Herakleitos, nehirlere değil de psişik enerji alanlarına giren bir tür erken kuantum fizikçisi olarak yeniden keşfedildi. "Belirsizlik ilkesi''nin mucidi Werner Heisenberg, onun görüşlerinin tamamen güncel hale getirilmesi için sadece azıcık bir düzeltmeye ihtiyaç olduğunu düşünerek şöyle yazıyordu:
Modern fizik pek çok açıdan Herakleitos'un öğretilerine aşırı derecede yaklaşmıştır. ''Ateş" kelimesini "enerji" kelimesiyle değiştirirsek, onun beyanını modern bakış açımızla kelimesi kelimesine tekrarlayabiliriz. Enerji aslında tüm temel parçacıkların, tüm atomların ve dolayısıyla her şeyin yapıldığı tözdür ve enerji hareket edendir ... Enerji, dünyadaki tüm değişimlerin en temel nedeni olarak adlandırılabilir.