Benzer şekilde antibiyotiklere erken dönemde maruz kalmanın, kritik bir noktada mikrobiyomu değiştirerek alerjiler, astım ve otoimmün hastalık riskini artırabileceği de akla yakındır; ancak obozitede riskler hala kesin olmayıp belirsizdir. Antibiyotiklerin faydaları çok daha açıktır. Nobel ödüllü Barry Marshall şöyle demiştir: " Kimseyi antibiyotikle öldürmedim ama antibiyotik almadığı için ölen epey insan biliyorum." Antibiyotiklerden önce basit sıyrıklar, ısırıklar, zatürre nedeniyle ya da doğum sırasında ölenlerin sayısı korkutucu düzeylerdeydi. Antibiyotiklerden sonra hayatı tehdit edebilecek bu durumlar daha fazla kontrol altına alınabilmiş, gündelik yaşam daha güvenli hale gelmiştir.
Fakat antibiyotikler şok ve dehşet silahlarıdır. Kurtulmak istediğimiz bakterilerin yanı sıra korumak istediklerimizi de öldürür; bu yaklaşım pire için yorgan yakmaya benzer. Katliamı başlatmak için azıcık kaşınmamız yeter.