Jüstinyen döneminde çıkarılan kanunlar, Helenistik dönem dinlere mensup olan topluluklar ve Maniheistler gibi Hıristiyan olmayan toplulukların katliama varan baskılara maruz kalmasına neden olmuştur. İznik Amentüsü'ne yürekten bağlı olan Jüstinyen, yönetimde kaldığı dönem boyunca kararlı hatta ihtiraslı biçimde bu yönde politikalar izlemiştir.