Nizamiye medreselerinde okutulan müfredat şu şekilde idi:
Din ve hukuk dersleri: Kur’an-ı Kerim kıraati, tefsir, hadis, fıkıh, kelam ve usul
Dil ve edebiyat dersleri: Arap edebiyatı, Fars edebiyatı, sarf,nahiv,hitabet,şiir, cerh ve ta’dil, tarih ve edeb
Felsefe dersleri: hikmet ve mantık
Müspet bilim dersleri: tıp,cerrahi, riyaziye, hesap, hendese,müsellesat,nücûm (astroloji) hey’et (astronomi) ve tabiiyat (coğrafya)