İmparatorluğun en yüksek ilim müessesesi olarak yaptırılan Semâniye medreselerine gelince, buraya yetkinlik gösteren her Müslüman çocuğu kabul olunurdu. Talebenin bütün masrafları vakıf gelirinden sağlanırdı. Yüksek dini ilimlerle beraber akli ve nakli ilimler (tababet, astronomi, matematik)okunurdu. Fatih, bu medreselerin teşkilatlandırılmasında Türkistan’dan getirdiği meşhur astronomi alimi Âli Kuşçu’dan istifade etmiştir.